aboutsummaryrefslogtreecommitdiff
path: root/scripts/dict_ontology_standardization/ncbi_countries.csv
diff options
context:
space:
mode:
Diffstat (limited to 'scripts/dict_ontology_standardization/ncbi_countries.csv')
-rw-r--r--scripts/dict_ontology_standardization/ncbi_countries.csv360
1 files changed, 29 insertions, 331 deletions
diff --git a/scripts/dict_ontology_standardization/ncbi_countries.csv b/scripts/dict_ontology_standardization/ncbi_countries.csv
index 772c0f2..b81da36 100644
--- a/scripts/dict_ontology_standardization/ncbi_countries.csv
+++ b/scripts/dict_ontology_standardization/ncbi_countries.csv
@@ -1,331 +1,29 @@
-30.59 N 114.3 E,http://www.wikidata.org/entity/Q11746
-35.92 N 74.33 E,http://www.wikidata.org/entity/Q609024
-39.54 N 116.23 E,http://www.wikidata.org/entity/Q198244
-Afghanistan,http://www.wikidata.org/entity/Q889
-Albania,http://www.wikidata.org/entity/Q222
-Algeria,http://www.wikidata.org/entity/Q262
-Andorra,http://www.wikidata.org/entity/Q228
-Angola,http://www.wikidata.org/entity/Q916
-Antigua and Barbuda,http://www.wikidata.org/entity/Q781
-Argentina,http://www.wikidata.org/entity/Q414
-Armenia,http://www.wikidata.org/entity/Q399
-Australia,http://www.wikidata.org/entity/Q408
-Australia: Queensland,http://www.wikidata.org/entity/Q36074
-Australia: Victoria,http://www.wikidata.org/entity/Q36687
-Austria,http://www.wikidata.org/entity/Q40
-Azerbaijan,http://www.wikidata.org/entity/Q227
-Bahrain,http://www.wikidata.org/entity/Q398
-Bangladesh,http://www.wikidata.org/entity/Q902
-Barbados,http://www.wikidata.org/entity/Q244
-Belarus,http://www.wikidata.org/entity/Q184
-Belgium,http://www.wikidata.org/entity/Q31
-Belize,http://www.wikidata.org/entity/Q242
-Benin,http://www.wikidata.org/entity/Q962
-Bhutan,http://www.wikidata.org/entity/Q917
-Bolivia,http://www.wikidata.org/entity/Q750
-Bosnia and Herzegovina,http://www.wikidata.org/entity/Q225
-Botswana,http://www.wikidata.org/entity/Q963
-Brazil,http://www.wikidata.org/entity/Q155
-Brunei,http://www.wikidata.org/entity/Q921
-Bulgaria,http://www.wikidata.org/entity/Q219
-Burkina Faso,http://www.wikidata.org/entity/Q965
-Burundi,http://www.wikidata.org/entity/Q967
-Cambodia,http://www.wikidata.org/entity/Q424
-Cameroon,http://www.wikidata.org/entity/Q1009
-Canada,http://www.wikidata.org/entity/Q16
-Cape Verde,http://www.wikidata.org/entity/Q1011
-Central African Republic,http://www.wikidata.org/entity/Q929
-Chad,http://www.wikidata.org/entity/Q657
-Chile,http://www.wikidata.org/entity/Q298
-China,http://www.wikidata.org/entity/Q148
-China: Anhui,http://www.wikidata.org/entity/Q40956
-"China: Anhui, Fuyang"":http://www.wikidata.org/entity/Q360584
-China: Beijing,http://www.wikidata.org/entity/Q956
-China: Chongqing,http://www.wikidata.org/entity/Q11725
-China: Fujian,http://www.wikidata.org/entity/Q41705
-China: Gansu,http://www.wikidata.org/entity/Q42392
-China: Guangdong,http://www.wikidata.org/entity/Q15175
-""China: Guangdong, Guangzhou",http://www.wikidata.org/entity/Q16572
-China: Guangxi Zhuang Autonomous Region,http://www.wikidata.org/entity/Q15176
-China: Guangzhou,http://www.wikidata.org/entity/Q16572
-China: Guizhou,http://www.wikidata.org/entity/Q47097
-China: Hangzhou,http://www.wikidata.org/entity/Q4970
-China: Hainan,http://www.wikidata.org/entity/Q42200
-China: Hebei,http://www.wikidata.org/entity/Q21208
-China: Heilongjiang,http://www.wikidata.org/entity/Q19206
-China: Henan,http://www.wikidata.org/entity/Q43684
-China: Hong Kong,http://www.wikidata.org/entity/Q8646
-China: HuaShang,http://www.wikidata.org/entity/Q148
-China: Hubei,http://www.wikidata.org/entity/Q46862
-"China: Hubei, Wuhan",http://www.wikidata.org/entity/Q11746
-China: Hunan,http://www.wikidata.org/entity/Q45761
-China: Inner Mongolia,http://www.wikidata.org/entity/Q41079
-China: Jiangsu,http://www.wikidata.org/entity/Q16963
-China: Jiangxi,http://www.wikidata.org/entity/Q57052
-China: Jilin,http://www.wikidata.org/entity/Q45208
-China: Liaoning,http://www.wikidata.org/entity/Q43934
-China: Macau,http://www.wikidata.org/entity/Q14773
-China: Nanchang,https://www.wikidata.org/wiki/Q171943
-China: Ningxia Hui Autonomous Region,http://www.wikidata.org/entity/Q57448
-China: Qinghai,http://www.wikidata.org/entity/Q45833
-China: Shaanxi,http://www.wikidata.org/entity/Q47974
-China: Shandong,http://www.wikidata.org/entity/Q43407
-China: Shanghai,http://www.wikidata.org/entity/Q8686
-China: Shanxi,http://www.wikidata.org/entity/Q46913
-China: Shenzhen,http://www.wikidata.org/entity/Q15174
-China: Sichuan,http://www.wikidata.org/entity/Q19770
-China: Tianjin,http://www.wikidata.org/entity/Q11736
-China: Tibet Autonomous Region,http://www.wikidata.org/entity/Q17269
-China: Wuhan,http://www.wikidata.org/entity/Q11746
-China:Wuhan,http://www.wikidata.org/entity/Q11746
-China: Xinjiang,http://www.wikidata.org/entity/Q34800
-China: Yunnan,http://www.wikidata.org/entity/Q43194
-China: Zhejiang,http://www.wikidata.org/entity/Q16967
-"China: Zhejiang, Hangzhou",http://www.wikidata.org/entity/Q4970
-Colombia,http://www.wikidata.org/entity/Q739
-Colombia: Antioquia,http://www.wikidata.org/entity/Q123304
-Comoros,http://www.wikidata.org/entity/Q970
-Costa Rica,http://www.wikidata.org/entity/Q800
-Croatia,http://www.wikidata.org/entity/Q224
-Cuba,http://www.wikidata.org/entity/Q241
-Czech Republic,http://www.wikidata.org/entity/Q213
-Democratic Republic of the Congo,http://www.wikidata.org/entity/Q974
-Denmark,http://www.wikidata.org/entity/Q35
-Djibouti,http://www.wikidata.org/entity/Q977
-Dominica,http://www.wikidata.org/entity/Q784
-Dominican Republic,http://www.wikidata.org/entity/Q786
-East Timor,http://www.wikidata.org/entity/Q574
-Ecuador,http://www.wikidata.org/entity/Q736
-Egypt,http://www.wikidata.org/entity/Q79
-El Salvador,http://www.wikidata.org/entity/Q792
-Equatorial Guinea,http://www.wikidata.org/entity/Q983
-Eritrea,http://www.wikidata.org/entity/Q986
-Estado Libre del Istmo,http://www.wikidata.org/entity/Q8842943
-Estonia,http://www.wikidata.org/entity/Q191
-Eswatini,http://www.wikidata.org/entity/Q1050
-Ethiopia,http://www.wikidata.org/entity/Q115
-Federated States of Micronesia,http://www.wikidata.org/entity/Q702
-Fiji,http://www.wikidata.org/entity/Q712
-Finland,http://www.wikidata.org/entity/Q33
-France,http://www.wikidata.org/entity/Q142
-Gabon,http://www.wikidata.org/entity/Q1000
-Georgia,http://www.wikidata.org/entity/Q230
-Germany,http://www.wikidata.org/entity/Q183
-Germany: Dusseldorf,https://www.wikidata.org/wiki/Q1718
-Ghana,http://www.wikidata.org/entity/Q117
-Greece,http://www.wikidata.org/entity/Q41
-Grenada,http://www.wikidata.org/entity/Q769
-Guatemala,http://www.wikidata.org/entity/Q774
-Guinea,http://www.wikidata.org/entity/Q1006
-Guinea-Bissau,http://www.wikidata.org/entity/Q1007
-Guyana,http://www.wikidata.org/entity/Q734
-Haiti,http://www.wikidata.org/entity/Q790
-Honduras,http://www.wikidata.org/entity/Q783
-Hungary,http://www.wikidata.org/entity/Q28
-Iceland,http://www.wikidata.org/entity/Q189
-Icelandic Commonwealth,http://www.wikidata.org/entity/Q62389
-India,http://www.wikidata.org/entity/Q668
-India: Kerala State,http://www.wikidata.org/entity/Q1186
-India: Rajkot,http://www.wikidata.org/entity/Q1815245
-Indonesia,http://www.wikidata.org/entity/Q252
-Iran,http://www.wikidata.org/entity/Q794
-Iran: Qum,http://www.wikidata.org/entity/Q131664
-Iran: Tehran,http://www.wikidata.org/entity/Q3616
-Iraq,http://www.wikidata.org/entity/Q796
-Ireland,http://www.wikidata.org/entity/Q27
-Israel,http://www.wikidata.org/entity/Q801
-Italy,http://www.wikidata.org/entity/Q38
-Italy: Cagliari,http://www.wikidata.org/entity/Q1897
-Italy: Rome,http://www.wikidata.org/entity/Q220
-Ivory Coast,http://www.wikidata.org/entity/Q1008
-Jamaica,http://www.wikidata.org/entity/Q766
-Japan,http://www.wikidata.org/entity/Q17
-Jordan,http://www.wikidata.org/entity/Q810
-Kazakhstan,http://www.wikidata.org/entity/Q232
-Kenya,http://www.wikidata.org/entity/Q114
-Kingdom of Denmark,http://www.wikidata.org/entity/Q756617
-Kingdom of the Netherlands,http://www.wikidata.org/entity/Q29999
-Kiribati,http://www.wikidata.org/entity/Q710
-Kuwait,http://www.wikidata.org/entity/Q817
-Kyrgyzstan,http://www.wikidata.org/entity/Q813
-Laos,http://www.wikidata.org/entity/Q819
-Latvia,http://www.wikidata.org/entity/Q211
-Lebanon,http://www.wikidata.org/entity/Q822
-Lesotho,http://www.wikidata.org/entity/Q1013
-Liberia,http://www.wikidata.org/entity/Q1014
-Libya,http://www.wikidata.org/entity/Q1016
-Liechtenstein,http://www.wikidata.org/entity/Q347
-Lithuania,http://www.wikidata.org/entity/Q37
-Luxembourg,http://www.wikidata.org/entity/Q32
-Madagascar,http://www.wikidata.org/entity/Q1019
-Malawi,http://www.wikidata.org/entity/Q1020
-Malaysia,http://www.wikidata.org/entity/Q833
-Maldives,http://www.wikidata.org/entity/Q826
-Mali,http://www.wikidata.org/entity/Q912
-Malta,http://www.wikidata.org/entity/Q233
-Marshall Islands,http://www.wikidata.org/entity/Q709
-Mauritania,http://www.wikidata.org/entity/Q1025
-Mauritius,http://www.wikidata.org/entity/Q1027
-Mexico,http://www.wikidata.org/entity/Q96
-Moldova,http://www.wikidata.org/entity/Q217
-Monaco,http://www.wikidata.org/entity/Q235
-Mongolia,http://www.wikidata.org/entity/Q711
-Montenegro,http://www.wikidata.org/entity/Q236
-Morocco,http://www.wikidata.org/entity/Q1028
-Mozambique,http://www.wikidata.org/entity/Q1029
-Myanmar,http://www.wikidata.org/entity/Q836
-Namibia,http://www.wikidata.org/entity/Q1030
-Nauru,http://www.wikidata.org/entity/Q697
-Netherlands: Milheeze,https://www.wikidata.org/wiki/Q3314115
-Nepal,http://www.wikidata.org/entity/Q837
-New Zealand,http://www.wikidata.org/entity/Q664
-Nicaragua,http://www.wikidata.org/entity/Q811
-Niger,http://www.wikidata.org/entity/Q1032
-Nigeria,http://www.wikidata.org/entity/Q1033
-Nigeria: Lagos,http://www.wikidata.org/entity/Q8673
-North Korea,http://www.wikidata.org/entity/Q423
-North Macedonia,http://www.wikidata.org/entity/Q221
-Norway,http://www.wikidata.org/entity/Q20
-Oman,http://www.wikidata.org/entity/Q842
-Ottoman Empire,http://www.wikidata.org/entity/Q12560
-Pakistan,http://www.wikidata.org/entity/Q843
-Pakistan: Gilgit,http://www.wikidata.org/entity/Q609024
-Pakistan: KPK,http://www.wikidata.org/entity/Q183314
-Palau,http://www.wikidata.org/entity/Q695
-Panama,http://www.wikidata.org/entity/Q804
-Papua New Guinea,http://www.wikidata.org/entity/Q691
-Paraguay,http://www.wikidata.org/entity/Q733
-People's Republic of China,http://www.wikidata.org/entity/Q148
-Peru,http://www.wikidata.org/entity/Q419
-Philippines,http://www.wikidata.org/entity/Q928
-Poland,http://www.wikidata.org/entity/Q36
-Portugal,http://www.wikidata.org/entity/Q45
-Principality of Turov and Pinsk,http://www.wikidata.org/entity/Q671362
-Qatar,http://www.wikidata.org/entity/Q846
-Republic of Cyprus,http://www.wikidata.org/entity/Q229
-Republic of Geneva,http://www.wikidata.org/entity/Q23366230
-Republic of the Congo,http://www.wikidata.org/entity/Q971
-Romania,http://www.wikidata.org/entity/Q218
-Russia,http://www.wikidata.org/entity/Q159
-Rwanda,http://www.wikidata.org/entity/Q1037
-Saint Kitts and Nevis,http://www.wikidata.org/entity/Q763
-Saint Lucia,http://www.wikidata.org/entity/Q760
-Saint Vincent and the Grenadines,http://www.wikidata.org/entity/Q757
-Samoa,http://www.wikidata.org/entity/Q683
-San Marino,http://www.wikidata.org/entity/Q238
-São Tomé and Príncipe,http://www.wikidata.org/entity/Q1039
-Saudi Arabia,http://www.wikidata.org/entity/Q851
-Senegal,http://www.wikidata.org/entity/Q1041
-Serbia,http://www.wikidata.org/entity/Q403
-Seychelles,http://www.wikidata.org/entity/Q1042
-Sierra Leone,http://www.wikidata.org/entity/Q1044
-Singapore,http://www.wikidata.org/entity/Q334
-Slovakia,http://www.wikidata.org/entity/Q214
-Slovenia,http://www.wikidata.org/entity/Q215
-Solomon Islands,http://www.wikidata.org/entity/Q685
-Somalia,http://www.wikidata.org/entity/Q1045
-South Africa,http://www.wikidata.org/entity/Q258
-South Africa: KwaZulu-Natal,http://www.wikidata.org/entity/Q81725
-South African Republic,http://www.wikidata.org/entity/Q550374
-South Korea,http://www.wikidata.org/entity/Q884
-South Sudan,http://www.wikidata.org/entity/Q958
-Spain,http://www.wikidata.org/entity/Q29
-Spain: Valencia,http://www.wikidata.org/entity/Q8818
-Sri Lanka,http://www.wikidata.org/entity/Q854
-State of Los Altos,http://www.wikidata.org/entity/Q738264
-Sudan,http://www.wikidata.org/entity/Q1049
-Suriname,http://www.wikidata.org/entity/Q730
-Sweden,http://www.wikidata.org/entity/Q34
-Switzerland,http://www.wikidata.org/entity/Q39
-Syria,http://www.wikidata.org/entity/Q858
-Taiwan,http://www.wikidata.org/entity/Q865
-Tajikistan,http://www.wikidata.org/entity/Q863
-Tanzania,http://www.wikidata.org/entity/Q924
-Thailand,http://www.wikidata.org/entity/Q869
-The Bahamas,http://www.wikidata.org/entity/Q778
-The Gambia,http://www.wikidata.org/entity/Q1005
-Togo,http://www.wikidata.org/entity/Q945
-Tonga,http://www.wikidata.org/entity/Q678
-Trinidad and Tobago,http://www.wikidata.org/entity/Q754
-Tunisia,http://www.wikidata.org/entity/Q948
-Tunisia: Tunis,http://www.wikidata.org/entity/Q3572
-Turkey,http://www.wikidata.org/entity/Q43
-Turkmenistan,http://www.wikidata.org/entity/Q874
-Tuvalu,http://www.wikidata.org/entity/Q672
-Uganda,http://www.wikidata.org/entity/Q1036
-Ukraine,http://www.wikidata.org/entity/Q212
-United Arab Emirates,http://www.wikidata.org/entity/Q878
-United Arab Republic,http://www.wikidata.org/entity/Q170468
-United Kingdom,http://www.wikidata.org/entity/Q145
-United States of America,http://www.wikidata.org/entity/Q30
-Uruguay,http://www.wikidata.org/entity/Q77
-USA,http://www.wikidata.org/entity/Q30
-USA: AK,http://www.wikidata.org/entity/Q797
-USA: AL,http://www.wikidata.org/entity/Q173
-USA: AR,http://www.wikidata.org/entity/Q1612
-USA: AZ,http://www.wikidata.org/entity/Q816
-USA: CA,http://www.wikidata.org/entity/Q99
-"USA: CA, San Diego County",http://www.wikidata.org/entity/Q108143
-USA: CO,http://www.wikidata.org/entity/Q1261
-USA: CT,http://www.wikidata.org/entity/Q779
-USA: DC,http://www.wikidata.org/entity/Q3551781
-USA: DE,http://www.wikidata.org/entity/Q1393
-USA: FL,http://www.wikidata.org/entity/Q812
-USA: GA,http://www.wikidata.org/entity/Q1428
-USA: HI,http://www.wikidata.org/entity/Q782
-USA: IA,http://www.wikidata.org/entity/Q1546
-USA: ID,http://www.wikidata.org/entity/Q1221
-USA: IL,http://www.wikidata.org/entity/Q1204
-USA: Illinois,http://www.wikidata.org/entity/Q1204
-USA: IN,http://www.wikidata.org/entity/Q1415
-USA: KS,http://www.wikidata.org/entity/Q1558
-USA: KY,http://www.wikidata.org/entity/Q1603
-USA: LA,http://www.wikidata.org/entity/Q1588
-"USA: New Orleans, LA",https://www.wikidata.org/wiki/Q34404
-USA: MA,http://www.wikidata.org/entity/Q771
-USA: MD,http://www.wikidata.org/entity/Q1391
-USA: ME,http://www.wikidata.org/entity/Q724
-USA: MI,http://www.wikidata.org/entity/Q1166
-USA: MN,http://www.wikidata.org/entity/Q1527
-USA: MO,http://www.wikidata.org/entity/Q1581
-USA: MS,http://www.wikidata.org/entity/Q1494
-USA: MT,http://www.wikidata.org/entity/Q1212
-USA: NC,http://www.wikidata.org/entity/Q1454
-USA: ND,http://www.wikidata.org/entity/Q1207
-USA: NE,http://www.wikidata.org/entity/Q1553
-USA: NH,http://www.wikidata.org/entity/Q759
-USA: NJ,http://www.wikidata.org/entity/Q1408
-USA: NM,http://www.wikidata.org/entity/Q1522
-USA: North Carolina,http://www.wikidata.org/entity/Q1454
-USA: NV,http://www.wikidata.org/entity/Q1227
-USA: NY,http://www.wikidata.org/entity/Q1384
-USA: New York,http://www.wikidata.org/entity/Q1384
-USA: OH,http://www.wikidata.org/entity/Q1397
-USA: OK,http://www.wikidata.org/entity/Q1649
-USA: OR,http://www.wikidata.org/entity/Q824
-USA: PA,http://www.wikidata.org/entity/Q1400
-USA: RI,http://www.wikidata.org/entity/Q1387
-"USA: San Francisco, CA",http://www.wikidata.org/entity/Q62
-USA: SC,http://www.wikidata.org/entity/Q1456
-USA: SD,http://www.wikidata.org/entity/Q1211
-"USA: Snohomish County, WA",http://www.wikidata.org/entity/Q110403
-USA: TN,http://www.wikidata.org/entity/Q1509
-USA: TX,http://www.wikidata.org/entity/Q1439
-USA: UT,http://www.wikidata.org/entity/Q829
-USA: VA,http://www.wikidata.org/entity/Q1370
-USA: VT,http://www.wikidata.org/entity/Q16551
-USA: WA,http://www.wikidata.org/entity/Q1223
-USA: WI,http://www.wikidata.org/entity/Q1537
-USA: WV,http://www.wikidata.org/entity/Q1371
-USA: WY,http://www.wikidata.org/entity/Q1214
-Uzbekistan,http://www.wikidata.org/entity/Q265
-Vanuatu,http://www.wikidata.org/entity/Q686
-Vatican City,http://www.wikidata.org/entity/Q237
-Venezuela,http://www.wikidata.org/entity/Q717
-Viet nam,http://www.wikidata.org/entity/Q881
-Viet Nam,http://www.wikidata.org/entity/Q881
-Viet Nam: Ho Chi Minh city,http://www.wikidata.org/entity/Q1854
-Vietnam,http://www.wikidata.org/entity/Q881
-Yemen,http://www.wikidata.org/entity/Q805
-Zambia,http://www.wikidata.org/entity/Q953
-Zimbabwe,http://www.wikidata.org/entity/Q954
+nasopharyngeal swab,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155831
+nasopharyngeal swabs,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155831
+nasopharyngeal exudate,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155831
+nasopharyngeal,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155831
+respiratory swab,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155831
+naso-pharyngeal exudate,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155831
+nasopharyngeal aspirate,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155831
+nasal swab specimen,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155831
+pharyngeal swab,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155831
+respiratory secretion,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155831
+mid-nasal swab,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155831
+nasopharyngeal (throat) washings,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155831
+oropharyngeal swab,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155835
+throat swab,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155835
+oro-pharyngeal,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155835
+buccal swab,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155835
+throat washing,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155835
+Throat Swab,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155835
+throat (oropharyngeal) swab,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C155835
+bronchoalveolar lavage fluid,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C13195
+swab,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C13195
+oral swab,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C13195
+bronchoalveolar lavage,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C13195
+sputum,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C13278
+aspirate,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C13347
+stool,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C13234
+serum,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C13325
+saliva,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C13275
+nasal swab,http://purl.obolibrary.org/obo/NCIT_C132119